報名日本的大學，與申請美國和英國大學那樣有統一的報考平臺不同，每個大學都使用獨自的“報名材料”和“線上報名網站”，需要針對每個大學進行準備。
在“報名材料”和“線上報名網站”上，除了需要填入個人資訊及學習經歷外，還需根據每個大學的規定提交各種指定的材料。
這些資料包括，高中畢業證明及成績證明、報考志願理由或短文、上文中有提到的【日本留學考試】的成績以及證明英語能力的【TOEFL ibt】成績等。

每間大學的報名時期都是根據自身需求所規定的。如下方表格所示，最早的報名時期大約在6月末左右。下表A群和B群僅將【第一次日本留學考試】的成績作為是否合格的判定標準，所以在申請A群及B群所包含的大學時，【第一次日本留學考試】的成績至關重要。
另外，在報名時，將【TOEFL ibt】成績提高到大學所設定的及格分也是必須的。另一方面，屬於C群及D群的國立大學，由於報名期大多都在10月份之後，所以當【第一次日本留學考試】和【第二次日本留學考試】都考過的情況下，可以選擇分數較高的一次的成績進行提交。

TYPE	報名時期	代表性大學	備註
A群	6月末以前	早稻田	僅限該年度第一回日本留學考試 6月時必須持有TOEFL iBT成績
B群	8月、9月	明治（文、商、綜合數理）、學習院、法政（前期）、 同志社（前期）、立命館（前期）、關西學院、關西（文科）	僅限該年度第一回日本留學考試 8-9月時必須持有TOEFL成績
C群	10月、11月	京都（經濟）、九州、橫浜國立（都市科學）、 慶應、上智、明治（B以外）、立教、中央 同志社（後期）、立命館（後期）、關西學院（後期）、關西（理科）	無論第一回日本留學考試成績及第二回日本留學考試成績都可作為審核物件 報名時需要TOEFL ibt成績
D群	12月以後	東京、名古屋、京都（工、農）、大阪、北海道、東北 一橋、東京工業、橫浜國立（經營、經濟、理工）	無論第一回日本留學考試成績及第二回日本留學考試成績都可作為審核物件 報名時需要TOEFL ibt成績

日本的大學合格判定基準，如下方表格所示，大致分為3種。
A群的大學只會根據報名時提交的材料進行合格判定，A群的大學不會再進行大學的個別入學考試。正如上文所述，A群的大學會根據報名時所提交的高中成績、報名志願理由書及短文、日本留學考試和TOEFL成績作合格判定。
另一方面，B群和C群的大學都需要進行大學個別的二次考試。在此，分為需要進行小論文和麵試考試的B群，以及另外還需進行科目考試的C群。

TYPE	審核方式	代表性大學
A群	僅憑材料審核是否合格 ※不舉行二次考試	早稻田（政治經濟、人間科學）、慶應（經濟、法）、明治（經營、商）、立教
B群	除材料審核外，還需二次考試的小論文、面試考試	東京、名古屋、九州、北海道、慶應（A以外）、上智、明治
C群	除材料審核外，加之小論文、面試考試，以及筆試考試	京都、大阪、東京工業、早稻田（理科）